Български отбор се нареди сред най-добрите 12 в Европа при осмото участие в новия формат на Шампионската лига. Популярната и престижна надпревара за Купата на европейските шампиони се превръща в Шампионска лига "Индезит" през 2000 г. Сред първите участници в новия формат е Левски Сиконко. При дебюта си сините са в група В с отборите на Мостостал, Пари Волей и АОН Хотволейс. Българите, в чийто състав са Дани Михайлов, Дани Пеев, Андрей Жеков, Владо Николов, Николай Найденов, Краси Стефанов, Мартин Стоев, записват две победи и четири загуби и завършват на трето място в потока.
През следващия сезон Пари Волей е сменен от Олимпиакос, останалите два отбора се повтарят. В състава на Левски пък вече са Боян Йорданов, Людмил Найденов, Пламен Христов, Петър Узунов. Резултатът отново е същия - две победи и трето място.
Най-успешното участие на Левски в Шампионската лига е през сезон 2002/03. Сините са в група с полския Честухова, гръцкия Олимпиакос и белгийския Нолико. Българският тим стартира слабо с две поражения и мнозина очакват поредното безлично представяне. В третия и четвъртия мач Левски печели срещу Честухова - като домакин и гост. Тогава поляците са отбор №1 във възраждащото се първенство на Полша.
Шансовете на родния шампион да продължи напред са живи до последния кръг, макар от груповата фаза да излиза само победителя и най-добрия втори тим. Именно като такъв се надяват да продължат и сините. В последната си среща българите печелят с 3:2 срещу Олимпиакос, в чийто състав е Пламен Константинов. Един гейм обаче ги разделя от излизането от групата, мястото напред получава немският Фридрихсхафен.
В следващите три участия в Шампионската лига сините записват общо 10 победи и 22 поражения. През лятото на 2007 г. от континенталната конфедерация променят за пореден път регламента на надпреварата.
Участието вече става по ранглиста и коефицент. Липсата на висок такъв оставя страната ни без представител в турнира през същия сезон. В последните две години България се върна сред най-добрите благодарение на отличните взаимоотношения на президента на ЦСКА Георги Георгиев с президента на европейската конфедерация Андре Майер и получаваната от червените уайлд кард.